各組職掌：

• 總務職掌

1. 文書管理
2. 印信典守
3. 各項會議召開
4. 財產及物品管理
5. 人事、出納、會計管理
6. 檔案管理

• 灌溉營運管理研究發展職掌

1. 灌溉營運管理研發計畫擬訂
2. 灌溉營運管理研發計畫執行
3. 灌溉營運管理研發計畫審查及推展

• 農田水利工程研究發展職掌

1. 農田水利工程研發計畫擬訂
2. 農田水利工程研發計畫執行
3. 農田水利工程研發計畫審查及推展
4. 農田水利工程新工法新技術之推展及各項農田水利工程基本資料建檔管理方法之擬定

• 農業環境保育研究發展職掌

1. 農業環境保育研發計畫擬訂
2. 農業環境保育研發計畫執行
3. 農業環境保育研發計畫審查及推展

• 資訊暨推廣職掌

1. 業務資料蒐集保管
2. 研究報告彙整推廣
3. 業務考察規劃辦理
4. 研發座談會
5. 公共關係